学院创办于1958年9月，前身为“泰县农业中等技术学校”；1959年1月，与泰州市农业专科学校合并为“泰州市农业专科学校”， 随之泰州市园艺学校并入，学校更名为“江苏省泰州农业学校”；1961年9月，扬州农业学校畜牧兽医专业并入，更名为“江苏省泰州畜牧兽医学校”；1995年4月，学校更名为“江苏省畜牧兽医学校”；2001年6月，经江苏省人民政府批准，成为江苏省首批独立升格的高等职业技术学院。

学院面向全国23个省市、自治区招生，现有在校生15000余人，教职工1000多人，设置了畜牧系、饲料科技系、兽医系、宠物科技系、食品科技系、动物药学系、园林科技系、经济贸易系、信息工程系、机电工程系和基础部共“十系一部”53个专业（方向），开设了10多个大专层次以上的函授学历教育，并对外开展职业技能培训。

半个世纪以来，江苏牧医学院励精图治、砥砺耕耘、革故鼎新、与时俱进，积淀了厚实的文化底蕴，奠定了“团结拼搏、负重奋进”的校风，铸就了“厚德垂范、博学济农”的教风，形成了“诚信立德，勤学致用”的学风。